Michel Jourdain comenzó su carrera en México a los 12 años en la categoría de Formula Junior, continuando en Formula K, Formula 2 y Prototipos. Ser hijo del famoso piloto mexicano Michel Jourdain y sobrino de otro reconocido piloto Bernard Jourdain, no ha hecho sino ponerle el liston bien alto en el mundo del automovilismo.

A los 19 años, seis meses y dos días, Jourdain Jr. se convirtio en el piloto más joven que participó oficialmente en un evento de CART en Long Beach, CA (1996).

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En 1997, Jourdain Jr participó en su primer temporada completa de las series del Campeonato Fedex, con el equipo Payton-Coyne Racing. A mitad de temporada el equipo realizó un cambio de chasis de un Lola a un Reynard 971, el chasis más competitivo en ese momento de todo el circuito; Jourdain obtiene entonces su primer punto de la serie en la carrera realizada en el circuito de Portland.

En el final de la temporada de 1997, en el circuito de California, Jourdain mantuvo el primer sitio por 19 minutos durante la etapa de calificación, a pesar de haber empezado la carrera en quinto lugar, lo que le mereció el respeto de los demás pilotos. Sus compañeros votaron a su favor y se convirtió en el "piloto que más mejoró" a lo largo de la temporada.

En 1998 Jourdain Jr. entró nuevamente en el equipo Ford-Cosworth/Reynard/Firestone. En la calles de Vancouver Canada, Jourdain quedó ubicado en la decima posición. Jourdain obtuvo 5 puntos dentro del campeonato, gracias a su desempeño en las competencias de Nazareth, Vancouver y California.

En el 2000 terminó en séptimo lugar en Australia, igualando su propio récord establecido en el Road América de 1999.