La cinta inicia con la llegada de la familia Grace a un nuevo hogar, en este lugar el atrevido Jared descubre un extraño libro secreto que no debería ser abierto. A partir de ese momento cosas inexplicables ocurren y criaturas monstruosas se ponen en pie de guerra para conseguir el libro. Lo que los hermanos Grace tienen en sus manos es un tratado en el que un antepasado suyo, Arthur Spiderwick, detalló los secretos de ese mundo oculto, y que ahora un malvado ogro llamado Mulgarath, quiere destruir.